【摘要】通過借鑒其他過敏原數據庫。利用圖書館和網絡資源搜集、查找、核對并收錄符合山東地區地理環境、物種分布特點的過敏原信息。建成數據庫并公布于互聯網上。供消費者免費查詢過敏原的物種來源、名稱、過敏原蛋白在蛋白質網的統一登陸號、分類學名稱、通用拉丁名、通用英文名、抗原表位、結構、糖蛋白構成、過敏原蛋白性狀描述等信息。該數據庫對摸清山東省過敏原的大致種類。方便過敏原信息的查詢。有針對性地檢測過敏原。提高過敏性疾病的防治水平具有重要意義。

　　【關鍵詞】過敏原；數據庫；蛋白質

　　前人們接觸過敏原的種類越來越復雜。資料顯示。目前已經確認的過敏原已達1500種［1］。發達約30％的人口受過敏性疾病影響［2］。因此。如何預測可能發生的過敏反應。快速有效檢測過敏原。對過敏性疾病的預防和治療至關重要。過敏原的種類和物候環境密切相關。不同或地區由于地理環境和物種分布的不同。形成了特定的過敏原群落。國外一些發達因醫學和食品安全的需要。已經建立了針對本國物種特點的過敏原數據庫。我國建立類似過敏原數據庫對過敏性疾病的防治以及過敏原檢測非常有必要。現就建立針對山東地區物種特點過敏原數據庫的情況報告如下。

　　1建庫目的

　　每個地區因地理環境、氣候等差異。物種分布并不相同。過敏素質基因也存在地區和種族多態性聚集性分布的現象。因此。引起過敏的過敏原種類在不同地區存在很大差異。一個人在某一地區居住出現過敏癥狀。在另一物候條件下不同的地區居住時過敏癥狀會消失或者加劇。對物候條件相似的地區建立過敏原數據庫。可以對本地區過敏原物種進行針對性篩查。可大大縮小過敏原篩查范圍。我國使用的過敏原試劑很多來自進口。有些根本不適合我國或山東省的過敏原檢測。針對地區物種分布特點建立過敏原數據庫后。可依據此數據庫。開發針對某一地區過敏原檢測試劑。提高過敏原檢測的針對性和準確性。避免使用本地區并不存在的過敏原對病人進行檢測。對過敏性疾病的預防和治療非常必要。還可滿足大眾對過敏性疾病知識的需求。也為醫療、食品安全、科研工作提供了標準和參考。

　　2建庫方法

　　（1）借鑒與山東地區物候相似、物種分布相近的日本食品安全過敏原數據庫（allergendatabaseforfoodsafety。ADFS）［3］及其他過敏原數據庫。查閱《山東植物精要》、《動物志》、《真菌學》、《昆蟲學》。將在山東地區有物種分布的過敏原納入數據庫中。國外數據庫中沒有。而山東省有的物種。檢索國外其他過敏原數據庫和國內的有關文獻。確定是否為山東省過敏原。如果是。納入在建的數據庫中。并補充相關條目說明。包括過敏原的編號。過敏原的種屬。過敏原的蛋白質序列。易致的過敏性疾病種類。引起過敏性疾病的概率。地理分布特點等。

　　（2）建立檢索途徑：收集完過敏原數據后。將過敏原按動物（animal）、植物（plant）、真菌（fun-gus）、昆蟲（insect）、螨蟲（mite）、麥角蛋白（gli-adin）、原生動物（protozoan）、蠕蟲（worm）、毒液／唾液（venom／salivary）。按過敏原名稱（name）、過敏原蛋白統一登陸號（uniprotacc）、分類學名稱（taxonamicname）、通用拉丁名（latinname）、通用英文名（englishname）、抗原表位（epitope）、結構（structure）、糖蛋白構成（sugar）、描述（descrip-tion）分別建立檢索途徑。

　　（3）建立網站連接：將通用拉丁名、通用英文名、抗原表位（epitope）、結構（structure）、糖蛋白構成（sugar）、描述（description）目錄下的條目與相應的蛋白質和基因網站建立連接。

　　（4）將建立好的過敏原數據庫公布于互聯網上。對數據庫網站進行更新、維護、完善。過敏原數據庫中在過敏原名稱和過敏蛋白統一登錄號中分別建立了站外鏈接。目的是通過利用相應核酸數據庫和蛋白質數據庫給出過敏原分子信息。如基因信息和氨基酸序列信息。由于鏈接到的站外數據庫是實行實時更新。這要求本數據庫也要進行定期更新。

　　3數據庫簡介和應用

　　對物候條件近似的地區建立過敏原數據庫。可以對本地區的過敏原有針對性地進行篩查。可大大縮小篩查范圍。我國使用的過敏原試劑多來自國外。依據本數據庫可開發針對本地區過敏原特點的過敏原檢測試劑。提高過敏原檢測的針對性和準確性。避免使用本地區并不存在的過敏原對病人進行檢測。節省人力和財力。同時對過敏性疾病的預防和治療非常必要。該過敏原數據庫除為醫療、食品安全、科研工作提供了標準和參考外。還可滿足大眾對過敏性疾病知識的需求。是面向變態反應領域的專業研究人員對過敏原信息查詢。也能滿足一般大眾對過敏原的認識需求。數據庫共收錄13類。共1043種過敏原。其中食入性動物過敏原49種。吸入性動物過敏原15種、食入性植物過敏原297種、吸入性植物過敏原344種、食入性真菌過敏原1種、吸入性真菌過敏原57種、吸入性昆蟲過敏原36種、吸入性螨蟲過敏原88種、毒液／唾液過敏原54種、接觸性過敏原57種、麥角蛋白過敏原23種、蠕蟲過敏原20種和原生動物過敏原2種。數據庫中收錄的784種過敏原源自山東地區的113個物種。用戶鍵入http：／／www。gmycx。com。進入數據庫首頁。顯示數據庫簡介、搜索方法、過敏原檢索欄。搜索的方法包括過敏原種類搜索、過敏原物種檢索、過敏原名稱搜索和模糊搜索四種方法。使用任意一種搜索方法均可以查到過敏原相關信息。包括過敏原的名稱。源自物種的拉丁名、英文名、中文名。過敏原統一登錄號。蛋白質和核酸結構、糖蛋白以及相關描述。

　　目前國外過敏原數據庫的一個重要功能是采用比較蛋白質序列與已知過敏蛋白質序列相似度的方法［3-4］對過敏性分子的致敏性進行評估。這種功能可以用于食品商業化前的安全性評估。還可以對通過轉基因編碼的蛋白質與已知過敏原進行序列相似性比較。為轉基因食品商業化前的安全性評估提供重要依據。過敏原數據庫與蛋白質數據庫和核酸數據庫鏈接提供過敏原的蛋白質和核酸編碼信息。在轉基因技術中。可以避免將編碼過敏原蛋白的目的基因引入轉基因物種。避免新型過敏蛋白的產生。由于技術、資金限制。本數據庫尚不具備蛋白質序列分析、蛋白質空間結構分析以及致敏性評估功能。僅能作為過敏原知識的信息平臺供用戶及研究人員查詢使用。

　　參考文獻

　　［1］Aplatformforallergenknowledge［EB／OL］。［2010-05-21］。

　　［2］KambleS。BharmalM。Incrementaldirectexpenditureoftrea-tingasthmaintheUnitedStates［J］。JAsthma。2009。46（1）：73-80。

　　［3］PearsonWR。LipmanDJ。Improvetoolsforbiologicalsequencecomparison［J］。ProcNatlAcadSciUSA。1988。85（8）：2444-2448。

　　［4］AltschulSF。GishW。Basiclocalalignmentsearchtool［J］。JMolBiol。1990。215（3）：403-41

　　程芳1康爾恂2